报告题目:深度学习在生物信息学中的应用
报 告 人:邓明华教授(北京大学)
报告时间:2020年6月24日 14:30
报告地点:腾讯会议 928292926
报告摘要:
本报告将向大家汇报一下最近一年内我们课题组的几个工作,集中在深度学习方法的应用之上。一个应用是DNA和蛋白质结合方面的研究,我们将EM算法的思想应用于CNN模型中,提高了DNA-蛋白质结合的预测效果;同时在模型中引入剪枝方法,提高了CNN模型中卷积核的可解释性。另一个应用是单细胞RNA测序数据的聚类,我们提出了融合AutoCoder与聚类目标的单细胞聚类算法scziDesk和ScDMFK。
报告人简介:
邓明华,北京大学数学科学学院教授。1991-1998年在北京大学数学学院学习,毕业后留校工作至今。2003年8月晋升为副教授,2006年任博士生导师,2009年8月晋升为教授。其间2001年2月-2003年8月在美国南加州大学计算分子生物学中心从事博士后研究工作,2009年8月-2010年1月美国耶鲁大学访问副教授。邓明华从事生物信息学研究,在生物序列分析、基因表达数据处理和网络分析等方面的研究中取得一定成果,发表SCI论文80余篇。曾先后主持5项自然科学基金面上项目和1项863项目,参加3项973项目、1项科技部重点研发项目、1项基金委创新团队项目和1项海外合作项目。