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科学计算系列学术报告:单细胞数据时空推断算法

发布人:日期:2024年06月16日 19:35浏览数:

报告题目:单细胞数据时空推断算法

报 告 人:史际帆研究员(复旦大学)

报告时间:2024618日  10:30

报告地点:格物楼数学研究中心528

报告摘要:

单细胞组学是近年来快速发展的前沿生物技术之一。通过不同的单细胞技术,可以从多个方面研究异质性细胞的演化过程。scRNA-seq数据往往失去了细胞的发育时间与空间位置等显式信息,而时空转录组往往费用昂贵且难以达到高通量。本次报告将介绍几种数学模型及算法,通过数据挖掘得到细胞分化过程的定量刻画。这些算法在数值算例和实际数据应用中取得了良好的效果。

报告人简介:

史际帆,复旦大学智能复杂体系基础理论与关键技术实验室青年副研究员,博士生导师。获北京大学计算数学博士与学士学位,曾任东京大学特任研究员。入选国家与上海市青年人才,获得科技部重大研究计划、国家自然青年基金等科研项目资助。研究领域包括计算生物学、随机模拟算法等,课题方向包括复杂网络、动力学因果、临界理论、单细胞组学与脑数据建模与分析等。近五年论文发表于Natl. Sci.Rev., PLoS Comput. Biol., J. R. Soc. Interface, Brief Bioinform等。

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